Team Aqua y Team Magma
En Pokémon Rubí Omega y Zafiro Alfa, tanto el Equipo Aqua como el Equipo Magma volverán a ser los antagonistas de los juegos, según la edición que escojamos, por supuesto. Los integrantes de ambos equipos han sido rediseñados acordes a la sexta generación, sin embargo son los mismos:
El Equipo Aqua está liderado por Aquiles. Justo por debajo de este en la cadena de mando están Matías y Silvina, sus dos comandantes. El resto de la organización lo forma un gran número de reclutas. Su misión es inundar la tierra con lluvias torrenciales y expandir los océanos.
El Equipo Magma se encuentra bajo la dirección de Magno. Sus ayudantes directos son sus dos comandantes: Tatiano y Carola y, a las órdenes de estos, trabaja un gran número de reclutas. Su objetivo es evaporar el agua de los océanos y aumentar la masa terrestre global.
